Under slaget ved Storbritannien, tyskeren Luftwaffe lancerer et tungt luftangreb på London. Kupplen på St. Paul's Cathedral blev gennemboret af en nazistisk bombe og efterlod højtalteret i ruin. Det var en af de få anledninger, at katedralen fra det 17. århundrede led betydelig skade under Tysklands næsten uophørlige bombeangreb på London i efteråret 1940.
I henhold til traditionen stod et romersk tempel til gudinden Diana engang på Ludgate Hill på stedet for St. Paul's Cathedral. I 604 A.D., kong Aethelberht I dedikerede den første kristne katedral der til St. Paul. Denne katedral brændte, og dens erstatning blev ødelagt af vikinger i 962. En tredje katedral blev ødelagt af brand i 1087 og blev erstattet af en storslået normandisk struktur, der blev afsluttet i det 13. århundrede. I det 16. århundrede faldt den fjerde katedral ned og blev beskadiget af brand, og yderligere skade blev foretaget under de engelske borgerkrig i det 17. århundrede. I 1660'erne blev den engelske arkitekt Sir Christopher Wren vervet for at reparere katedralen, men London-branden greb ind og ødelagde Old St. Paul's Cathedral i 1666.
I kølvandet på ilden designede Wren en ny St. Paul's Cathedral, med snesevis af mindre nye kirker, der varierede omkring det som satellitter. Katedralen var Wren's mesterværk, med et barok design og en fremtrædende, statelig kuppel. Wren selv satte fundamentblokken i 1675 og i 1710 satte den endelige sten på plads. Da arkitekten døde i 1723, blev han begravet med stor ceremoni i St. Paul's. En indskrift nær hans grav læser, Lector, si monumentum demandis, circumspice”Latin for“ Læser, hvis du søger et monument, skal du kigge efter dig. ”Mange andre bemærkelsesværdige britiske borgere sluttede sig senere med ham i St. Pauls krypter, herunder de militære helte Lord Nelson og hertugen af Wellington.
St. Paul's Cathedral blev en inspiration for det britiske folk under 2. verdenskrig. I slaget ved Storbritannien forsøgte Luftwaffe at bombe Storbritannien til underkastelse ved at banke London og andre større byer, men St. Pauls mirakuløst undslap store bombeskader, selv da historiske bygninger i nærheden blev reduceret til murbrokker. Billeder af St. Paul's indrammet af røg og ild blev et symbol på Storbritanniens ukuelige ånd. Civile forsvarsbrigader, inklusive St. Paul's Fire Watch, beskyttede strukturen mod brand, og på et tidspunkt blev en ueksploderet bombe fjernet med stor risiko fra katedralens tag. På trods af skaderne forårsaket natten den 9. oktober 1940 overlevede katedralen Blitz stort set intakt. I 1944 ringede St. Paul's klokker til at fejre frigørelsen af Paris, og i 1945 blev der deltaget i tjenester, der markerede slutningen af krigen i Europa, af 35.000 mennesker.
