De første kolonister til Maryland ankommer St. Clement's Island på Marylands vestkyst og fandt bosættelsen St. Mary's.
I 1632 udstedte kong Charles I af England et charter til George Calvert, den første Lord Baltimore, hvilket gav ham ejendomsret til en region øst for Potomac-floden i bytte for en andel af indtægterne fra landet. Området blev opkaldt Maryland til ære for Henrietta Maria, dronningskonsort af Charles I. Før bosættelsen begyndte, døde George Calvert og blev efterfulgt af hans søn Cecilius, der forsøgte at etablere Maryland som et tilflugtssted for romersk katolikker forfulgt i England. I marts 1634 ankom de første engelske nybyggere en omhyggeligt udvalgt gruppe katolikker og protestanter på St. Clement's Island ombord på Ark og Due.
Religiøs konflikt var stærk i de efterfølgende år, da de amerikanske puritaner, der voksede flere i Maryland og støttet af puritaner i England, satte sig ind for at tilbagekalde de religiøse frihedsrettigheder, der blev garanteret ved grundlæggelsen af kolonien. I 1649 reagerede Maryland guvernør William Stone ved at vedtage en handling, der sikrede religiøs frihed og retfærdighed til alle, der troede på Jesus Kristus. I 1654 blev den såkaldte tolerancelov imidlertid ophævet, efter at puritanerne greb kontrollen over kolonien, hvilket førte til en kort borgerkrig, der endte med, at Lord Baltimore mistede kontrollen over ejendomsretten over Maryland i marts 1655.
Selv om kalverterne senere genvandt kontrol over Maryland, var den anti-katolske aktivitet vedvarende indtil 1800-tallet, hvor mange katolske indvandrere til Amerika valgte Baltimore som deres hjem og hjalp med at vedtage love for at beskytte deres frie religion.
